第一組
1.各項傳染病防治
2.預防接種與指導
3.優生保健（含婦幼健康與兒童保健）
4.中老人病防治
5.癌症防治（含口腔、大腸、子宮頸及乳癌等四癌篩檢）
6.慢性病代謝症候防治（含糖尿病共同照護網）
7.社區健康營造
8.健康促進（含老人及職場健康促進）
9.長期照護
10.社區心理衛生
11.老人假牙、菸害防制戒菸服務及衛教宣導
12.緊急災害應變及CPR教育訓練
13.菸害稽查業務
第二組
◎藥政業務
1.藥商、藥局設立、變更及停歇業登記事項等業務及普查與輔導
2.藥商（含中藥商）、藥局藥事人員執業、變更與停歇業登記事項業務管理及稽查與輔導
3.實施醫藥分業診所、藥局、西藥販賣藥事人員執業情形
4.機構（醫院、診所、藥局、動物醫院、藥商販賣業、藥商製造業）申請管制藥品登記證停、歇業及變更業務
5.管制藥品銷毀、減損業務及輔導查核
6.用藥安全、藥物濫用宣導
7.藥品化粧品醫療器材之不法查緝及違規案件與廣告之移送查處（含人民陳情申訴檢驗案件）
◎醫政業務
1.各類醫事機構（含診所各類醫事機構檢驗所各類醫事機構放射所物理治療所、牙體技術所、心理諮商所、聽力所等）開、歇業及變更管理及稽查與輔導
2.各類醫事人員（醫師、護理人員、助產士）執（歇）業、異動管理
3.各類醫事人員 執（歇）業、異動管理(備註:護理人員、營養師、醫療院所藥師請至衛生局醫政事務科辦理)
4.密醫及醫事人員非法執業查辦及陳情案件（含廣告案件）
5.辦理醫事機構及人員卡（RAO系統）
6.勞工健檢業務
7.救護車管理、民防
◎食品業務
1.食品製造業、販賣業餐飲場所之衛生管理及稽查輔導
2.疑似食物中毒案件調查採證等處理
3.食品衛生安全及國民營養宣導
4.食品違規廣告監錄及違規食品案件調查（含人民陳情申訴檢驗案件）
5.市售食品標示稽查
6.加水站業務
◎營業衛生業務
1.營業衛生類別事業單位管理稽查與輔導
2.營業衛生例行採樣送驗
3.輔導營業衛生自主管理與衛生管理人衛生講習